16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1152 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1152  protein of unknown function DUF106 transmembrane  100 
 
 
292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1735  protein of unknown function DUF106 transmembrane  37.5 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.128032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2254  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.36 
 
 
319 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2320  protein of unknown function DUF106 transmembrane  35.94 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512856  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1913  protein of unknown function DUF106 transmembrane  33.45 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.438936  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0269  protein of unknown function DUF106 transmembrane  36.08 
 
 
318 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0106  hypothetical protein  27.67 
 
 
211 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0467  protein of unknown function DUF106 transmembrane  31.64 
 
 
199 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0557  hypothetical protein  26.15 
 
 
203 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338126  normal  0.183955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2228  hypothetical protein  26.34 
 
 
201 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0589  hypothetical protein  26.8 
 
 
206 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.652146  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1704  hypothetical protein  27.87 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0026  hypothetical protein  24.65 
 
 
206 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000132729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0084  integral membrane protein  25.84 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0420165  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1129  hypothetical protein  24.87 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  24.85 
 
 
589 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>