More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6719 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6719  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.33 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  42.33 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.33 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.8 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  42.33 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  42.86 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  41.27 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.33 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12460  translation factor SUA5  41.88 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.149253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  42.63 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  40.21 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  40.74 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  40.74 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.3 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.39 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.39 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.31 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.95 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  40.21 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1230  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.39 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000496118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.86 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  41.8 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  39.68 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.58 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.04 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.68 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1787  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  39.68 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  39.15 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  39.68 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.74 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.27 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.59 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0903  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4990  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.86 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.21 
 
 		 222 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.18 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.15 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.1 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20060  translation factor SUA5  40.1 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507285  hitchhiker  0.00225661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.08 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.42 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  39.15 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.15 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3610  hypothetical protein  42.11 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.57 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  37.57 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.57 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2032  translation factor SUA5  42.33 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.57 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.21 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5412  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.38 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3232  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.68 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.049079  normal  0.0745237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1795  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.74 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00222469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.51 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.15 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.62 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  38.95 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.27 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  34.18 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.39 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000417278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.74 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.68 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.51 
 
 		 221 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.51 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.68 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.98 
 
 		 221 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.21 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.21 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  41.45 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.15 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2693  translation factor SUA5  36.45 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.98 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  39.68 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  39.68 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.62 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  39.15 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.63 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>