More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3947 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3947  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  100 
 
 		 408 aa  826    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4055  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  58.12 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  57.58 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.663891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1853  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.24 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0936768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1613  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.16 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0266912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2643  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  53.9 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1982  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.53 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.157941  normal  0.0125598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0156  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.39 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.983052  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2191  carbamoyl phosphate synthase small subunit  53.55 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2240  carbamoyl phosphate synthase small subunit  55.24 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0975  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  52.97 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1858  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0698  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  51.92 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.110228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0585  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.77 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0152244  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1774  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.65 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004479  carbamoyl-phosphate synthase small chain  51.68 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1771  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.13 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0224697  normal  0.089739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1620  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.55 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3086  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  52.82 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0580438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2527  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.68 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2328  carbamoyl phosphate synthase small subunit  54.55 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1273  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.13 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0938  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  51.94 
 
 		 385 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.742428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1968  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.41 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.837999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.39 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3648  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0073  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.64 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00912  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.53 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1898  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.13 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2310  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.13 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0072  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.51 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.955538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2299  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.87 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000401664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0070  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.64 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00036  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3567  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0036  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.09 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0770  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1475  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.41 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00035  hypothetical protein  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1608  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4932  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.9 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0032  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2783  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.92 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02244  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.11 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0231375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1505  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.41 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1281  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.697849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0587  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0033  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0591  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.26 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3623  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62930  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0564  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.25 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0074  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.51 
 
 		 382 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3621  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.75 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2885  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.77 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2083  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.42 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1731  carbamoyl phosphate synthase small subunit  51.53 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2679  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.76 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2194  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.63 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2215  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.25 
 
 		 381 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000311671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2940  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.26 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2459  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.61 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4724  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103863  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1051  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.64 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.098868  hitchhiker  0.0000017806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1141  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.74 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2823  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.76 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4590  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3841  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5478  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.39 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4432  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0107  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.51 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3401  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.51 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00720177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4725  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.9 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2113  carbamoyl phosphate synthase small subunit  47.73 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000982338  normal  0.988223 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0559  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  46.79 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3526  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.64 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42940  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1003  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.51 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0354323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1261  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.78 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3019  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.84 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1148  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  50.76 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0863472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2504  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.36 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1519  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.26 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4035  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.85 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4502  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  49.49 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.723109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3578  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.98 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0674639  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0766  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.36 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00373051  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0218  carbamoyl phosphate synthase small subunit  48.98 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4142  carbamoyl phosphate synthase small subunit  49.88 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2004  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.64 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2729  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.6 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0778  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  48.85 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.42563  hitchhiker  0.000147727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1261  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.38 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0131767  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3986  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.38 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0967  carbamoyl phosphate synthase small subunit  50.26 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00370508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3359  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  48.97 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2392  carbamoyl-phosphate synthase small subunit  50.38 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>