More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2045 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
414 aa  844    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  35.1 
 
 
460 aa  266  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  34.83 
 
 
432 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.55 
 
 
417 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  35.57 
 
 
399 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.65 
 
 
463 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.41 
 
 
430 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0852323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  32.46 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.49 
 
 
438 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  30.5 
 
 
435 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  32.54 
 
 
458 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
433 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.58 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  32.08 
 
 
438 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  28.81 
 
 
413 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.03 
 
 
425 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  31.99 
 
 
453 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.42 
 
 
413 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  30.22 
 
 
433 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.14 
 
 
445 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.96 
 
 
413 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  27.62 
 
 
442 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.37 
 
 
445 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  29.86 
 
 
441 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  29.21 
 
 
507 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  29.22 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.5 
 
 
442 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  30.82 
 
 
428 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  26.5 
 
 
442 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  27.05 
 
 
442 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  27.05 
 
 
442 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  27.39 
 
 
442 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.16 
 
 
423 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  30.11 
 
 
430 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.29 
 
 
437 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  32.64 
 
 
426 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.17 
 
 
442 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.09 
 
 
442 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  26.73 
 
 
442 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.64 
 
 
417 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.02 
 
 
409 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.27 
 
 
408 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.54 
 
 
452 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  26.73 
 
 
442 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  26.73 
 
 
442 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.86 
 
 
433 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.84 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  26.7 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  29.62 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1167  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.88 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.68 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.37 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.27 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.48 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.75 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  27.4 
 
 
442 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.28 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  28.29 
 
 
416 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.6 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  30.32 
 
 
434 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  30.05 
 
 
412 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.01 
 
 
431 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  30.88 
 
 
445 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  26.6 
 
 
450 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.81 
 
 
438 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.27 
 
 
439 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.02 
 
 
408 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.54 
 
 
408 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  28 
 
 
449 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
453 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.54 
 
 
407 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.4 
 
 
432 aa  142  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.54 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.54 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.54 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  29.54 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.65 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.78 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.54 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.8 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.88 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.84 
 
 
414 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  28.44 
 
 
433 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.62 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.98 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.4 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.34 
 
 
411 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.11 
 
 
465 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.04 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.07 
 
 
471 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.46 
 
 
411 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.53 
 
 
406 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  30.02 
 
 
431 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.97 
 
 
430 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>