More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2792 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 417 aa  824    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.5 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0852323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  39.66 
 
 		 432 aa  266  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  38.53 
 
 		 460 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.1 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.25 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  37.59 
 
 		 435 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  36.34 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.63 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.84 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  37.17 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  31.94 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  33 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.83 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  32.76 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.94 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  32.76 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  31.94 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  36.26 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.9 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  35.13 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  31.77 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  32.19 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.68 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.57 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.78 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  36.17 
 
 		 438 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.52 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  31.98 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  34.59 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  33.57 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  35.44 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.57 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  34.05 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.41 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  33.57 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  34.59 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.85 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.68 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.97 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.53 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.88 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.73 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.01 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.69 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.47 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.47 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.53 
 
 		 411 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.88 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.45 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.09 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.41 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.83 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.35 
 
 		 417 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  31.71 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  30.91 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  33.17 
 
 		 412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.78 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32 
 
 		 445 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.08 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2668  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.18 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58229  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.93 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.62 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.5 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  33.49 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.38 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.48 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.3 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.63 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.73 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.91 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.02 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.63 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  31.04 
 
 		 446 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  31.4 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3298  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.54 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0329  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2412  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1190  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.21 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.63 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.63 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  31.63 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.68 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.63 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.01 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.31 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.63 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.34 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  28.74 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  34.21 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.3 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.58 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2540  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.45 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.14 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.16 
 
 		 418 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>