More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2310 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
430 aa  853    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0852323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.5 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  35.12 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  37.01 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  35.77 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.7 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6394  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.81 
 
 
409 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5493  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.65 
 
 
406 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590714  hitchhiker  0.000600534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4940  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.39 
 
 
406 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  32.4 
 
 
435 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  32.99 
 
 
435 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.91 
 
 
442 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.31 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.11 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.16 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2217  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.07 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566124  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0031  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.11 
 
 
406 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.07 
 
 
405 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.28 
 
 
433 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.82 
 
 
438 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.31 
 
 
438 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  30.77 
 
 
441 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  33.75 
 
 
438 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2157  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.98 
 
 
411 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.44 
 
 
463 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3333  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.5 
 
 
410 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0308305  hitchhiker  0.000758619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.33 
 
 
425 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.55 
 
 
411 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0201  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.03 
 
 
405 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  31.49 
 
 
445 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.51 
 
 
407 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.51 
 
 
407 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.51 
 
 
407 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.51 
 
 
407 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  30.82 
 
 
433 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  31.51 
 
 
407 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.24 
 
 
452 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.51 
 
 
407 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3302  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.9 
 
 
402 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.600114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.25 
 
 
407 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  30.13 
 
 
425 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
417 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.8 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.9 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3747  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.05 
 
 
411 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.673936  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.81 
 
 
442 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.12 
 
 
465 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6130  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.36 
 
 
408 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.25 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  30.22 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2016  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.58 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43310  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.93 
 
 
405 aa  146  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.24 
 
 
442 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.24 
 
 
442 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.01 
 
 
442 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  29.21 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  29.24 
 
 
442 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  29.95 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  26.46 
 
 
450 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.24 
 
 
442 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.94 
 
 
419 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70670  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  37.11 
 
 
408 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.95 
 
 
442 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.08 
 
 
410 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2039  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.98 
 
 
402 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  33.01 
 
 
472 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.96 
 
 
474 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.89 
 
 
420 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  30.75 
 
 
428 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  27.78 
 
 
442 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.72 
 
 
447 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.72 
 
 
447 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1639  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.79 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.602692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.17 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.29 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  28.95 
 
 
507 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.62 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  29.21 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  31.07 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.68 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1896  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.78 
 
 
404 aa  140  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.95 
 
 
439 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  30.42 
 
 
453 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1887  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.4 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0156765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  31.44 
 
 
426 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.69 
 
 
408 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  31.77 
 
 
416 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.46 
 
 
471 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.42 
 
 
445 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4397  hypothetical protein  30.77 
 
 
431 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  31.66 
 
 
412 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.89 
 
 
408 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  28.83 
 
 
447 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1360  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.63 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.83 
 
 
447 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  27.85 
 
 
449 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  32.35 
 
 
411 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.67 
 
 
445 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  29.77 
 
 
433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2498  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.23 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.813169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>