More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0937 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  875    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0339  hypothetical protein  41.78 
 
 
460 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  42.89 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  37.98 
 
 
445 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.71 
 
 
433 aa  250  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  37.17 
 
 
441 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  36.21 
 
 
413 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2792  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.66 
 
 
417 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000832381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.31 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.9 
 
 
413 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.82 
 
 
442 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  33.82 
 
 
442 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  34.57 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  33.33 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
442 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
442 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.66 
 
 
413 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  33.58 
 
 
442 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  33.58 
 
 
442 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  33.33 
 
 
442 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
442 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.96 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  37.05 
 
 
435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  33.9 
 
 
450 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.03 
 
 
465 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.06 
 
 
463 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.89 
 
 
445 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.68 
 
 
414 aa  230  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.59 
 
 
447 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  35.99 
 
 
435 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.71 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.55 
 
 
474 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.47 
 
 
447 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.71 
 
 
447 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.96 
 
 
543 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  35.23 
 
 
428 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.82 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2579  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.4 
 
 
437 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  35.44 
 
 
425 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.01 
 
 
471 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.08 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  35.41 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.05 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.77 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0852323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  33.89 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3202  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.04 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  35.63 
 
 
453 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4135  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.55 
 
 
437 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.25 
 
 
453 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  34.86 
 
 
458 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2548  hypothetical protein  36.04 
 
 
436 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.78 
 
 
440 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.38 
 
 
420 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  35.65 
 
 
472 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4734  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.27 
 
 
437 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.960339  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.84 
 
 
438 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1829  hypothetical protein  33.57 
 
 
437 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.751801  normal  0.279512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.18 
 
 
445 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.67 
 
 
447 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5789  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.01 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
402 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  34.69 
 
 
438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0396  hypothetical protein  33.98 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.165591  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1868  hypothetical protein  33.96 
 
 
439 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1323  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.26 
 
 
437 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2500  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.77 
 
 
439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1901  hypothetical protein  32.69 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3012  hypothetical protein  33.17 
 
 
435 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  34.43 
 
 
426 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  34.35 
 
 
447 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.7 
 
 
436 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2678  hypothetical protein  33.02 
 
 
433 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.15494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  32.77 
 
 
446 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  31.88 
 
 
507 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.73 
 
 
437 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1018  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.02 
 
 
433 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2200  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.04 
 
 
411 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  34.74 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.19 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0993  hypothetical protein  33.41 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  0.19287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0223  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.54 
 
 
401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  32.19 
 
 
465 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3437  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.9 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0044  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.32 
 
 
410 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1664  glycolate oxidase subunit, (Fe-S)protein, GlcF  30.16 
 
 
441 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118574  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02846  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.488957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0719  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3150  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0723  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3255  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02796  hypothetical protein  35.9 
 
 
407 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2304  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  35.18 
 
 
405 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0497  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.25 
 
 
436 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0210  hypothetical protein  32.24 
 
 
433 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.4758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  34.62 
 
 
416 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2894  hypothetical protein  33.09 
 
 
434 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.184588  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5641  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  34.61 
 
 
423 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.636346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0361  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.66 
 
 
443 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>