82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0379 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 463 aa  936    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0645  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  38.51 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2202  SalD  36.93 
 
 		 430 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.476706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1799  long-chain fatty acid transport protein  38.89 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.471886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0576  putative long-chain fatty acid transport protein  32.33 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00218092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  32.35 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3199  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.02 
 
 		 394 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0555142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.21 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3106  hypothetical protein  27.66 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.09 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2180  long-chain fatty acid ABC transporter  28.15 
 
 		 381 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000739013  hitchhiker  0.00000487757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  27.13 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2776  putative transporter protein  27.18 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356239  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.57 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0747  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.95 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.2 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.89 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2170  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.23 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000480388  decreased coverage  0.000000000685095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2542  outer membrane protein, OMPP1/FadL/TodX family  27.23 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0142574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.73 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.77 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1486  toluene transport protein, putative  24.41 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000112602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.36 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0449  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.38 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0456  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.96 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000969908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2053  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.4 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000452049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  24.82 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1467  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.88 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3814  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.62 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0090168  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2883  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.26 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.66 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  24.56 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.94 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.29 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.09 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4639  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.95 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3563  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.95 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.361655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  22.25 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  23.64 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1307  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.36 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44634  normal  0.0300258 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001387  long-chain fatty acid transport protein  25.87 
 
 		 368 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  23.53 
 
 		 460 aa  57  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.61 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06385  hypothetical protein  27.52 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.9 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.74 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.57 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000636439  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  24.46 
 
 		 424 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2901  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.23 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875359  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.22 
 
 		 428 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.47 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1618  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.55 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000079524  decreased coverage  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.02 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5672  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.56 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224746  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  25.08 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.87 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1535  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.63 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.67 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  22.22 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.09 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2771  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.71 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000776056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.82 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.41 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000167182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.94 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3037  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.77 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000400429  normal  0.0267167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.49 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  25.4 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0378  outer membrane protein transport protein, OMPP1/FadL/TodX family  23.65 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0548  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.65 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117969  hitchhiker  0.0000578498 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.99 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.99 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  19.94 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.99 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  24.48 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  22.09 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  21.14 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  24.11 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0561  long-chain fatty acid transport protein  22.14 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>