90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1486 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1486  toluene transport protein, putative  100 
 
 		 473 aa  969    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000112602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  64.96 
 
 		 466 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0843  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  59.75 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  58.58 
 
 		 475 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  55.11 
 
 		 461 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  53.85 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1467  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.54 
 
 		 468 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2776  putative transporter protein  32.4 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356239  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4639  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.19 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3563  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.19 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.361655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0821  long-chain fatty acid transport like protein  30 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3814  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.37 
 
 		 464 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0090168  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1535  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.73 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  27.07 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2901  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.87 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875359  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2883  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.39 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5672  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.71 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1307  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.72 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44634  normal  0.0300258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  24.31 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.41 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0449  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.17 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0456  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.99 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000969908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.67 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2542  outer membrane protein, OMPP1/FadL/TodX family  24.44 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0142574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2170  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.44 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000480388  decreased coverage  0.000000000685095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.08 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.95 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0747  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.99 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.74 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.73 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.22 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2053  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.36 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000452049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2180  long-chain fatty acid ABC transporter  21.37 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000739013  hitchhiker  0.00000487757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  19.83 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  22.57 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2498  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.39 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.953303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2202  SalD  23.02 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.476706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  22.3 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0645  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  22.43 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.24 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.55 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0576  putative long-chain fatty acid transport protein  22.55 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00218092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.13 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.11 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2534  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.9 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0440745  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.3 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1799  long-chain fatty acid transport protein  24.38 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.471886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.48 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.91 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.95 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.81 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.45 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.8 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.63 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  24.38 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.25 
 
 		 450 aa  53.5  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.56 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.66 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  20.3 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.48 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.56 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.86 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2771  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.41 
 
 		 434 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000776056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.05 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.36 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.82 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41750  hypothetical protein  24.81 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.88 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.42 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.71 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  20.53 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1450  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.17 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153151  unclonable  0.0000000000946875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.26 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3199  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.08 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0555142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.04 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.81 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  21.65 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.08 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3543  hypothetical protein  22.56 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.1 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.77 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  21.04 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.96 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.59 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.54 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1773  hypothetical protein  20.29 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.67 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.68 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>