123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0352 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0352  protein of unknown function DUF502  100 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.219023  normal  0.241205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1108  protein of unknown function DUF502  56.67 
 
 
221 aa  231  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000527544  normal  0.0291695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2020  protein of unknown function DUF502  59.9 
 
 
208 aa  227  9e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2928  protein of unknown function DUF502  52.11 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0948  protein of unknown function DUF502  53.43 
 
 
229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3889  protein of unknown function DUF502  47.6 
 
 
206 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1290  protein of unknown function DUF502  41.63 
 
 
228 aa  158  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1143  protein of unknown function DUF502  27.6 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2699  hypothetical protein  27.96 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1520  hypothetical protein  27.09 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1647  protein of unknown function DUF502  25.93 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000282003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2517  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  72  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2566  protein of unknown function DUF502  25.93 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000782195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0557  protein of unknown function DUF502  26.27 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0474  protein of unknown function DUF502  30.14 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1611  hypothetical protein  30.28 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201117  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1516  hypothetical protein  27.49 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1826  hypothetical protein  26.97 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000356216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1551  hypothetical protein  26.56 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0009  hypothetical protein  28.5 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0865  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2056  hypothetical protein  28.85 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0008  hypothetical protein  26.13 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00071  hypothetical protein  26.13 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3078  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.181609 
 
 
-
 
NC_002936  DET0989  hypothetical protein  27.84 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0889  hypothetical protein  29.21 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000902902  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00071  hypothetical protein  26.13 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1202  protein of unknown function DUF502  26.18 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0172325  normal  0.43521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1598  protein of unknown function DUF502  24.14 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1340  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00071  hypothetical protein  27.23 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0009  hypothetical protein  27.72 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2193  protein of unknown function DUF502  28.29 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0786  hypothetical protein  25.93 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3638  hypothetical protein  26.13 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3561  protein of unknown function DUF502  28.57 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.687423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4164  hypothetical protein  24.52 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1878  protein of unknown function DUF502  22.66 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2935  protein of unknown function DUF502  24.39 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1546  hypothetical protein  25.98 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.172364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5454  hypothetical protein  26.37 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1590  hypothetical protein  25.62 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1729  hypothetical protein  25.6 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.183823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2853  hypothetical protein  24.15 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0702  hypothetical protein  23.65 
 
 
215 aa  55.5  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.368955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_861  hypothetical protein  26.32 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0205305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1433  hypothetical protein  25.13 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1497  hypothetical protein  26.77 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000491692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2309  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0182653  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1705  hypothetical protein  25.59 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00122818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0635  hypothetical protein  26.53 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000323056  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0880  hypothetical protein  24.75 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.677623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1171  protein of unknown function DUF502  22.84 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1893  hypothetical protein  25.38 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0372929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4123  protein of unknown function DUF502  23.44 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.132754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0873  hypothetical protein  22.75 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0802  protein of unknown function DUF502  22.75 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0513  protein of unknown function DUF502  32.48 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0167  hypothetical protein  25.4 
 
 
195 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0702076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0275  hypothetical protein  24.38 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2731  hypothetical protein  23.94 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0836269  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1260  protein of unknown function DUF502  28.02 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.633328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1325  hypothetical protein  24.5 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00071  hypothetical protein  28.22 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00081  hypothetical protein  26.34 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2755  protein of unknown function DUF502  25.51 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1335  hypothetical protein  28.22 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0597  hypothetical protein  24 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2607  hypothetical protein  23.83 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.575169  normal  0.902425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2619  hypothetical protein  22.44 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231699  hitchhiker  0.00087146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00071  hypothetical protein  27.14 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2470  hypothetical protein  24.29 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000599046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1488  hypothetical protein  25.62 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0149  hypothetical protein  24.29 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0170  hypothetical protein  24.29 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0315  protein of unknown function DUF502  25.62 
 
 
216 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1069  putatives membrane protein  22.12 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2385  hypothetical protein  23.88 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.476873  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0088  transmembrane protein  22.68 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0736  hypothetical protein  22.54 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0380  hypothetical protein  23.83 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2172  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.353364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0465  hypothetical protein  25.1 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4012  hypothetical protein  25.2 
 
 
219 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000640772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0355  protein of unknown function DUF502  25.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0340  protein of unknown function DUF502  25.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1296  hypothetical protein  24.16 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0427  hypothetical membrane spanning protein  23.41 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1746  hypothetical protein  23.41 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.120309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4044  hypothetical protein  23.94 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130299  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2920  protein of unknown function DUF502  28.47 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4528  protein of unknown function DUF502  24.75 
 
 
281 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0441  transmembrane protein  24.37 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4159  hypothetical protein  24.75 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.999365  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0851  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.415191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2753  hypothetical protein  23 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2325  hypothetical protein  23 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0674  hypothetical protein  23 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.745943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0690  hypothetical protein  23 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>