83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0023 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6030  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285404  normal  0.189385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.959732  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0028  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102951  normal  0.0568899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.0549747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0004  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.657407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0058  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102505  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0040  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0275291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0006  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0051  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000442391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0050  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000354715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0053  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0051  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138562  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>