299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_R0048 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0051  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0014  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  98.65 
 
 
76 bp  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0053  tRNA-Lys  95.95 
 
 
76 bp  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  90.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  90.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  90.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  92.31 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  90.91 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00000608308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000220613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2505  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000358439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000000687096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0033  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561489  normal  0.861574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0033  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106516  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0053  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146858  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000213443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0034  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000816877  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0034  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225096  normal  0.395781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000107091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  87.14 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156611  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  87.14 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118155  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000039183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0039  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0033  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224831  normal  0.39291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0052  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000077031  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000497879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000000318687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0034  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000927259  normal  0.865314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0012  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00139972  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0031  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0032  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000000399959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0015  tRNA-Asn  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000090416  normal  0.096467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  87.69 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  87.69 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0044  tRNA-Asn  87.69 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.975167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  95.12 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0029  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0902412  normal  0.0228096 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0031  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161243  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0059  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000863176  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0040  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000158111  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0041  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000136051  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0040  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0040  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345644  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0030  tRNA-Asn  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0040  tRNA-Thr  86.11 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238807  hitchhiker  0.0000185517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>