299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0053 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0053  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0047  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0051  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0048  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0014  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0012  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00142633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0028  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0013  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0002  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0017  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0045  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000133581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0062  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000647678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0063  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000418863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.666985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>