123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1625 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1625  YaeQ family protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0474626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  34.78 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  33.95 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2092  hypothetical protein  34.64 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  34.57 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1726  YaeQ  32.54 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.251645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  32.75 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  34.97 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  42.42 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  33.71 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  33.71 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  33.13 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  31.48 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  30.91 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1394  hypothetical protein  36.75 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16210  hypothetical protein  36.42 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39450  YaeQ family protein  35.19 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.566633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1894  YaeQ family protein  35.23 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2326  YaeQ family protein  35.39 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001459  hypothetical protein  30.68 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1476  YaeQ family protein  32.12 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  27.93 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4245  YaeQ family protein  32.12 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1081  YaeQ family protein  32.12 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0545  YaeQ family protein  27.68 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  40.19 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  29.27 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05395  hypothetical protein  28.41 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3382  YaeQ family protein  32.1 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1034  YaeQ  32.12 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  30.06 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  30.06 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  28.66 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  29.88 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  32.48 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  24 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  31.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  27.81 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  29.88 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  29.88 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  29.88 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  27.93 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  31.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4143  YaeQ family protein  30.72 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1487  hypothetical protein  32.12 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  29.38 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  28.14 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0193  hypothetical protein  31.1 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1297  YaeQ  31.52 
 
 		 228 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  29.45 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  28.05 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  43.27 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  28.05 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  28.05 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  27.44 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  28.05 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  31.03 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  31.1 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  45.28 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  29.89 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0195  hypothetical protein  31.1 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  40.19 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  28.05 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  29.01 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  27.49 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  39.25 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  26.38 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  26.83 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  30.41 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  39.25 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  42.31 
 
 		 251 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  27.65 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  40.38 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  40.38 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  40.38 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  39.25 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  39.25 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  28.83 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0729  YaeQ family protein  25.86 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  26.32 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  27.61 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  27.61 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  27.61 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  31.18 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>