123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0680 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  57.06 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  57.63 
 
 		 183 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  55.25 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  54.7 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  57.06 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  56.11 
 
 		 187 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  55.19 
 
 		 251 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  56.18 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  55.62 
 
 		 207 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  55.62 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  56.18 
 
 		 184 aa  204  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  54.19 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  55.06 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  54.65 
 
 		 181 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  52.33 
 
 		 181 aa  201  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  54.49 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  52.33 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  51.91 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  50.58 
 
 		 182 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  55.62 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  55.62 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  55.62 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  51.11 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  51.91 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  51.18 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  52.33 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  51.11 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  46.15 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  48.02 
 
 		 180 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  45.76 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  48.55 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  46.24 
 
 		 179 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0193  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  46.02 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  47.78 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  47.78 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  45.86 
 
 		 184 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  47.78 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  47.78 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  47.78 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  47.98 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  47.98 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  47.98 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  47.98 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  48.89 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  47.4 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  45.3 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  47.4 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  47.4 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0729  YaeQ family protein  47.78 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  47.4 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  47.13 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  47.4 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0195  hypothetical protein  47.22 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  46.82 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  47.09 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3377  YaeQ family protein  49.72 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4027  YaeQ family protein  49.72 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  45.66 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0854  YaeQ family protein  46.41 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  49.08 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  47.09 
 
 		 184 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5170  YaeQ family protein  47.8 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1157  YaeQ family protein  46.41 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  51.55 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  47.13 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  47.13 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  47.13 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  46.29 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  51.98 
 
 		 182 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4048  YaeQ  44.75 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  44.51 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4670  YaeQ family protein  47.51 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  38.64 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  40.96 
 
 		 179 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  40.65 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2631  YaeQ family protein  40.24 
 
 		 183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3227  YaeQ family protein  39.05 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994476  normal  0.0845748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2602  YaeQ  39.64 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2646  YaeQ family protein  39.64 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  40.76 
 
 		 178 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  36.84 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  40.24 
 
 		 179 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2925  YaeQ family protein  38.46 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39450  YaeQ family protein  38.89 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.566633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  38.15 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>