123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2189 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  50.56 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  50 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  51.12 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  50 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  50 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  50 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  50.56 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  50.56 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  50.56 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  50.56 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  51.22 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  46.02 
 
 		 202 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  51.46 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  47.75 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  48.31 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  47.16 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  47.75 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  48.26 
 
 		 184 aa  170  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  41.57 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  48.26 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  47.37 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  42.7 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  44.38 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  46.29 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  43.89 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  42.46 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  45.66 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  42.86 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  41.9 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  43.82 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  43.75 
 
 		 178 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  41.44 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  43.45 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  46.51 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  46.51 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  46.51 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  41.99 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  40.45 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  40.33 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  40.45 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  42.46 
 
 		 251 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  42.44 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  43.64 
 
 		 178 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4048  YaeQ  41.4 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0854  YaeQ family protein  40.86 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  42.35 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  45.09 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  45.09 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  42.86 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  42.86 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  45.09 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  42.86 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  41.34 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  45.09 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  41.34 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  45.09 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  42.35 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  42.86 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1157  YaeQ family protein  36.02 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  41.42 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4027  YaeQ family protein  38.17 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3377  YaeQ family protein  38.17 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  40.7 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0729  YaeQ family protein  42.77 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  42.07 
 
 		 179 aa  144  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  42.6 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  42.77 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0195  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0193  hypothetical protein  42.94 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  40.24 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  41.46 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  39.88 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  42.95 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4670  YaeQ family protein  37.63 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5170  YaeQ family protein  38.17 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  42.01 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001459  hypothetical protein  36.87 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  42.6 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3227  YaeQ family protein  34.97 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994476  normal  0.0845748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2092  hypothetical protein  36.69 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39450  YaeQ family protein  40.49 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.566633  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05395  hypothetical protein  44.27 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  40 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16210  hypothetical protein  35.63 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>