123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3761 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  100 
 
 
182 aa  380  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  77.53 
 
 
182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  77.53 
 
 
182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  77.53 
 
 
182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  76.37 
 
 
184 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  74.73 
 
 
184 aa  293  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  72.78 
 
 
184 aa  283  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  73.48 
 
 
182 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  65.92 
 
 
181 aa  257  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  66.48 
 
 
181 aa  257  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  65.36 
 
 
181 aa  256  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0193  hypothetical protein  65.36 
 
 
181 aa  256  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  66.48 
 
 
181 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  66.48 
 
 
181 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  66.48 
 
 
181 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  64.8 
 
 
181 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  64.8 
 
 
181 aa  254  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  64.8 
 
 
181 aa  254  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  64.8 
 
 
181 aa  254  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  64.8 
 
 
181 aa  254  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  65.92 
 
 
181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.135669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0195  hypothetical protein  64.25 
 
 
181 aa  251  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0729  YaeQ family protein  63.48 
 
 
181 aa  247  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251373  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  54.76 
 
 
181 aa  197  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  47.49 
 
 
184 aa  191  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  48.85 
 
 
182 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  49.44 
 
 
180 aa  188  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  48.55 
 
 
178 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  48.26 
 
 
193 aa  184  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  47.73 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  51.2 
 
 
184 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  47.98 
 
 
179 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  48.55 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  48.55 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  48.55 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  47.98 
 
 
181 aa  177  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  49.13 
 
 
184 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  48.81 
 
 
184 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  49.1 
 
 
184 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  46.51 
 
 
179 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  48.81 
 
 
184 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  49.1 
 
 
184 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  47.13 
 
 
202 aa  175  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  50 
 
 
251 aa  175  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  48.81 
 
 
207 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  46.24 
 
 
181 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  46.24 
 
 
181 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  46.24 
 
 
181 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  46.24 
 
 
181 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  46.24 
 
 
181 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  46.82 
 
 
178 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  45.98 
 
 
183 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  45.98 
 
 
183 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  48.21 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  46.24 
 
 
179 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  40.88 
 
 
182 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  43.93 
 
 
181 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  48.17 
 
 
213 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  41.44 
 
 
181 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  42.22 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  48.81 
 
 
184 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  48.81 
 
 
184 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  44.51 
 
 
179 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  48.81 
 
 
184 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  44.02 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  45.66 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  43.35 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  43.2 
 
 
184 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4048  YaeQ  44.15 
 
 
206 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0854  YaeQ family protein  43.32 
 
 
186 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.158201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5170  YaeQ family protein  40.64 
 
 
186 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  44.83 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  43.02 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  39.23 
 
 
179 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  42.78 
 
 
182 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1157  YaeQ family protein  38.5 
 
 
186 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  41.81 
 
 
185 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  41.81 
 
 
185 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3377  YaeQ family protein  39.04 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4670  YaeQ family protein  39.57 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4027  YaeQ family protein  39.04 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  39.78 
 
 
181 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  37.22 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2092  hypothetical protein  38.6 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  37.21 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1894  YaeQ family protein  39.77 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  36.46 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0545  YaeQ family protein  40.94 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1726  YaeQ  38.65 
 
 
181 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.251645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  37.64 
 
 
177 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2186  hypothetical protein  37.57 
 
 
179 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644819  decreased coverage  0.00295467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2326  YaeQ family protein  38.6 
 
 
181 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05395  hypothetical protein  36.52 
 
 
181 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>