123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1476 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1476  YaeQ family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4245  YaeQ family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1081  YaeQ family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4143  YaeQ family protein  97.22 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1297  YaeQ  92.78 
 
 		 228 aa  349  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1034  YaeQ  92.22 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1487  hypothetical protein  91.67 
 
 		 180 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39450  YaeQ family protein  76.54 
 
 		 179 aa  290  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.566633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1394  hypothetical protein  73.18 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16210  hypothetical protein  73.18 
 
 		 179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3382  YaeQ family protein  70.56 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1726  YaeQ  45.4 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.251645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  46.63 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  44.51 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2092  hypothetical protein  41.01 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0545  YaeQ family protein  44.17 
 
 		 180 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  40.24 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  40.8 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  39.05 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  38.64 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  40.24 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  38.07 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  38.98 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  39.63 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  39.63 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  38.76 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1894  YaeQ family protein  42.7 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2326  YaeQ family protein  43.26 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  39.02 
 
 		 207 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  39.63 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  38.2 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  36.11 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  39.63 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  39.63 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  39.63 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  39.88 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  34.81 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  40.91 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  37.85 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  37.85 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  37.43 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  43.37 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  39.55 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  41.07 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  38.69 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  34.66 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  38.69 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  39.39 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  37.93 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  40.12 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  36.59 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  37.21 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  39.26 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  36.31 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  37.79 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  38.65 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  38.86 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  36.84 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  35.63 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  39.16 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  35.56 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  38.29 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  38.29 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  38.29 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  37.58 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  36.97 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  36.75 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  36.75 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  36.75 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  36.75 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  36.2 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  35.67 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  36.05 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  37.85 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  39.31 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  36.84 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2602  YaeQ  37.28 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  35.15 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2646  YaeQ family protein  37.28 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2631  YaeQ family protein  37.28 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2925  YaeQ family protein  37.28 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001459  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  32.76 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  35.06 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  32.76 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  32.76 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  36.21 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>