123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3382 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3382  YaeQ family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39450  YaeQ family protein  80.45 
 
 		 179 aa  300  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.566633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1394  hypothetical protein  77.65 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16210  hypothetical protein  77.65 
 
 		 179 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1034  YaeQ  71.11 
 
 		 180 aa  283  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1476  YaeQ family protein  70.56 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4245  YaeQ family protein  70.56 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1081  YaeQ family protein  70.56 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1297  YaeQ  70 
 
 		 228 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1487  hypothetical protein  69.44 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4143  YaeQ family protein  70.56 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3563  YaeQ family protein  46.95 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1726  YaeQ  48.82 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.251645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4015  YaeQ family protein  46.63 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0545  YaeQ family protein  42.7 
 
 		 180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2092  hypothetical protein  41.57 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  42.37 
 
 		 251 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  41.57 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  41.57 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  41.01 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  41.01 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  42.13 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  41.24 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  41.24 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  40 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  39.43 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  41.01 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  41.01 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  41.01 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  38.64 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  40.11 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  39.2 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1894  YaeQ family protein  43.82 
 
 		 181 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2228  YaeQ family protein  38.64 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.297124  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  40.22 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  40.22 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2326  YaeQ family protein  43.82 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  38.33 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  37.35 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  39.88 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  40.23 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  40.23 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  39.55 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  36.72 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  36.11 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  38.18 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  39.89 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  36.26 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  36.81 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  39.01 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  34.48 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  34.86 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  36.72 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  35.09 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  34.29 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  34.29 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  34.29 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  38.65 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  35.71 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  35.03 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  31.49 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  33.33 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  33.14 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  34.08 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  34.52 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  36.16 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  32.73 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  32.73 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  32.73 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  32.73 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  38.01 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  34.46 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  33.71 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001459  hypothetical protein  36.09 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  35.67 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  36.84 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  38.15 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  31.52 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  31.64 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  33.91 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  35.63 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  34.27 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  34.27 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  34.27 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  34.27 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  34.27 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>