More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0276 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0276  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000858967  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
107 aa  103  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
106 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  53.4 
 
 
106 aa  96.7  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.86 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  44.34 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
106 aa  92  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
110 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  42.45 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  41.51 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  47.27 
 
 
107 aa  87  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
110 aa  87  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  42.11 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 
116 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 
106 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
108 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  44.34 
 
 
104 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  43.4 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  46.15 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  42.2 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  39.29 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  43.59 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  42.45 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  40.57 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  42.86 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  42.34 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  45.37 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  41.12 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  43.4 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  43.4 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  40.59 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  41.82 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  42.59 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  38.1 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  38.1 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  40.54 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  42.06 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  37.04 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  39.64 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  39.09 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3513  ribosomal protein L24  44.34 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000647333  hitchhiker  0.0000000884976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  39.64 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>