164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3416 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3416  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 377 aa  728    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  34.16 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  30.56 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.31 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.81 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.79 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  29.61 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  27.11 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  22.35 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  22.63 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.15 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  22.47 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  24.55 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  25.69 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.55 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.92 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  25.62 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  22.19 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.47 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.6 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  24.47 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  24.6 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  24.59 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  22.45 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  23.63 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  24.92 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  23.75 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  23.1 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  23.23 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2227  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  23.29 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  23.29 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  23.29 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  23.29 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.87 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  23.87 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  23.29 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  21.8 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  23.1 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 792 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  24.77 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0821  hypothetical protein  23.48 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.05 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.43 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.25 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.67 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.67 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>