69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4698 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 464 aa  925    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  99.35 
 
 		 464 aa  917    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  98.71 
 
 		 464 aa  915    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  66.23 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  66.02 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  65.01 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  66.22 
 
 		 465 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  65.23 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  65.23 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  65.23 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  65.23 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  64.43 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  56.09 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  56.09 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  56.09 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  45.49 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  45.49 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  42.3 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  44.87 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  56.86 
 
 		 189 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  56.1 
 
 		 127 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  28.45 
 
 		 457 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  60.71 
 
 		 243 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  68.75 
 
 		 114 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  36.9 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  25 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  25 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  25.44 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  25.44 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  25.44 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  25.05 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  25.97 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  25.97 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  23.08 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  23.35 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.64 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.64 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.64 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.64 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.64 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  25.61 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  25.31 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>