35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0739 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  360  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 464 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  58.26 
 
 		 464 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  58.26 
 
 		 464 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  61.74 
 
 		 465 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  56.52 
 
 		 464 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 462 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  57.39 
 
 		 462 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  54.88 
 
 		 433 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  54.88 
 
 		 433 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  54.88 
 
 		 433 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  46.28 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  39.6 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1180  hypothetical protein  71.11 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  39.18 
 
 		 473 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  38.3 
 
 		 468 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  55.17 
 
 		 127 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>