93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3030 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  79 
 
 
482 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  78.54 
 
 
467 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
482 aa  974    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
482 aa  974    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
482 aa  974    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  65.84 
 
 
442 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  81.64 
 
 
329 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  45.91 
 
 
458 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  45.91 
 
 
458 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  85.56 
 
 
191 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  45.41 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  45.9 
 
 
307 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  37.55 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  50.55 
 
 
96 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  26.22 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  26.22 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  31.71 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  22.4 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  60.78 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  19.52 
 
 
467 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  19.52 
 
 
469 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  19.72 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
464 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 
464 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
433 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
433 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
433 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  19.52 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  24.03 
 
 
446 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  24.03 
 
 
446 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  19.43 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  23.28 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  22.62 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  22.62 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  25.64 
 
 
190 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  24.27 
 
 
441 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>