136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0088 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  100 
 
 
420 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
484 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 
451 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 
472 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  24.87 
 
 
472 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 
472 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 
451 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  26.09 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  26.09 
 
 
465 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  25.25 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  25.07 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  25.07 
 
 
465 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  24.32 
 
 
466 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  27.8 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  27.8 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  27.8 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  27.8 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  27.41 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  22.54 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  22.54 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  22.54 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  22.54 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  25.66 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  21.23 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  28.91 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  21.23 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  22.4 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  22.4 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  22.4 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  21.22 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  21.22 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  22.09 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  21.28 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  21.68 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  21.68 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  22.26 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  22.26 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  22.26 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  23.11 
 
 
447 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  23.77 
 
 
329 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  24 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  23.73 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  23.73 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  23.73 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>