81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1413 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  100 
 
 
472 aa  968    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  99.79 
 
 
472 aa  964    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  99.58 
 
 
472 aa  965    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  97.4 
 
 
472 aa  903    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  97.62 
 
 
472 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  95.37 
 
 
291 aa  558  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  22.91 
 
 
451 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  25.25 
 
 
484 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  24.53 
 
 
484 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
484 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  24.16 
 
 
420 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  24.04 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.29 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  22.29 
 
 
465 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  21.65 
 
 
465 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  21.09 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  23.56 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  23.56 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  23.56 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  25.75 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  22.84 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1199  hypothetical protein  27.92 
 
 
198 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  19.72 
 
 
451 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  26.12 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  21.44 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  22.97 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  20 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  20.87 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  20.87 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  21.63 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  22.26 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  20.97 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  22.44 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  20.75 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  22.44 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  19.5 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
469 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  21.41 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  21.41 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  21.41 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  23.97 
 
 
307 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>