40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4617 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  100 
 
 
329 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  81.37 
 
 
482 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  81.37 
 
 
482 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  81.37 
 
 
482 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  73.86 
 
 
482 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  73.2 
 
 
467 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  62.41 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  38.44 
 
 
408 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 
458 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  38.44 
 
 
458 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  34.25 
 
 
457 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  42.34 
 
 
307 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  45.56 
 
 
96 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  61.7 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  23.77 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  24.92 
 
 
472 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 
472 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 
472 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  24.18 
 
 
447 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  24.18 
 
 
447 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  23.36 
 
 
441 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  24.26 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  24.26 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  27.49 
 
 
447 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>