50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2717 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  47.39 
 
 
482 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  47.39 
 
 
467 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  45.9 
 
 
482 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  45.9 
 
 
482 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  45.9 
 
 
482 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  48.2 
 
 
442 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
458 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
458 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  44.26 
 
 
408 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  50.3 
 
 
191 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  34.97 
 
 
456 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  34.97 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  42.34 
 
 
329 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  28.86 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  29.19 
 
 
468 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  29.19 
 
 
468 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  27 
 
 
473 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
453 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  21.09 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  26.07 
 
 
457 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
472 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 
457 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  22.38 
 
 
446 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  22.38 
 
 
446 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 
472 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
472 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
457 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
457 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 
457 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  23.21 
 
 
411 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.99 
 
 
472 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>