72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1020 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  97.62 
 
 
472 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  97.4 
 
 
472 aa  904    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  98.09 
 
 
472 aa  951    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  99.79 
 
 
472 aa  967    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  100 
 
 
472 aa  971    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  99.31 
 
 
291 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  22.55 
 
 
451 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
484 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  24.93 
 
 
484 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  24.66 
 
 
484 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  23.64 
 
 
420 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  21.86 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  21.65 
 
 
465 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  23.78 
 
 
253 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  21.09 
 
 
466 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  19.67 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  25.75 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1199  hypothetical protein  27.92 
 
 
198 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  26.12 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  20.18 
 
 
451 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  22.27 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  22.27 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  22.27 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  21.44 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  21.12 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  22.7 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  19.5 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  23.1 
 
 
307 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  20.71 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  20.71 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
469 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  22.43 
 
 
447 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  23.53 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  21.29 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  21.29 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  21.29 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>