75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3238 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
467 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  98.93 
 
 
467 aa  961    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  99.36 
 
 
467 aa  967    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
467 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
467 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
411 aa  862    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
467 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
467 aa  974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  99.34 
 
 
469 aa  946    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
331 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  96.84 
 
 
190 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  46.36 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  45.91 
 
 
457 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  45.91 
 
 
457 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  46.36 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  46.36 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  46.36 
 
 
457 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 
457 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 
453 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2011  hypothetical protein  35.34 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.271694  normal  0.217697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  22.96 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  22.96 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  22.83 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.72 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.72 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.72 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.64 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.63 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  22.52 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  22.52 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  19.74 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  23.43 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  23.43 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  21.69 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  20.7 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  21.43 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  21.43 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  22.48 
 
 
439 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  19.69 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  20.67 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  28.23 
 
 
191 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.13 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  19.43 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>