65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4786 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  100 
 
 		 442 aa  890    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  65.84 
 
 		 482 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  65.84 
 
 		 482 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  65.84 
 
 		 482 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  65.42 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  65.42 
 
 		 467 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  45.12 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  45.12 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  62.64 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  44.54 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  48.52 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  67.96 
 
 		 191 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 		 457 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  34.09 
 
 		 456 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  49.45 
 
 		 96 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  22.34 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  26.97 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  26.97 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  26.3 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  26.3 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  26.3 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  28.28 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  28.28 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  28.28 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  28.28 
 
 		 462 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  24.04 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  24.04 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  26.55 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  23.48 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  21.95 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.95 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  23.48 
 
 		 472 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  20.37 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  20.68 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  23.48 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  20.99 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  20.99 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  20.99 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  20.99 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  20.99 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  20.81 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  29.85 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  20.5 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  23.89 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>