74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2903 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  99.79 
 
 
484 aa  1002    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  91.32 
 
 
484 aa  927    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  1006    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  91.12 
 
 
484 aa  925    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0309  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0108977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  40.5 
 
 
451 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1475  hypothetical protein  80.39 
 
 
111 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1623  hypothetical protein  92.94 
 
 
85 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  27.61 
 
 
420 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 
472 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 
472 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  25 
 
 
472 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 
472 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
472 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  22.35 
 
 
456 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  22.35 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  21.24 
 
 
457 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  21.03 
 
 
457 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  21.24 
 
 
457 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  21.24 
 
 
457 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  21.24 
 
 
457 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  21.03 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  21.03 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  21.2 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  21.2 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  20.73 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  20.73 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  20.73 
 
 
457 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  24.3 
 
 
291 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  23.24 
 
 
494 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1199  hypothetical protein  26.21 
 
 
198 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1749  hypothetical protein  24.36 
 
 
288 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.167509 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  23.11 
 
 
441 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
446 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
446 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2094  hypothetical protein  36.71 
 
 
106 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.263502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1750  hypothetical protein  36.71 
 
 
106 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.147174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  22.05 
 
 
465 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.31 
 
 
465 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  25.89 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  21.9 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  24.3 
 
 
466 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2093  hypothetical protein  24.47 
 
 
240 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.8 
 
 
397 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.8 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.8 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.8 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.8 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  20.79 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  21.95 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>