124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4308 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  73.38 
 
 
447 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  73.38 
 
 
447 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  100 
 
 
447 aa  907    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  70.79 
 
 
447 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  46.38 
 
 
435 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 
448 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  47.83 
 
 
448 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  44.04 
 
 
468 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  44.04 
 
 
468 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  44.04 
 
 
468 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  44.04 
 
 
468 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  44.04 
 
 
468 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  44.55 
 
 
468 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  43.17 
 
 
456 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  41.75 
 
 
420 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  69.48 
 
 
241 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  41.6 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  41.6 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  41.6 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  41.86 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  41.6 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  36.83 
 
 
441 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  33.82 
 
 
494 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  33.72 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  34.31 
 
 
433 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  34.31 
 
 
433 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  34.31 
 
 
433 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  34.31 
 
 
433 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  49.39 
 
 
325 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  65.83 
 
 
177 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  37.3 
 
 
255 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  29.16 
 
 
451 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  29.16 
 
 
451 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  29.16 
 
 
451 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  29.16 
 
 
451 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  29.16 
 
 
451 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  35.74 
 
 
263 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  44.59 
 
 
198 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  28.31 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  35.95 
 
 
167 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  47 
 
 
111 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  26.91 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  24.57 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2324  transposase, IS4  33.88 
 
 
118 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0625912  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0089  hypothetical protein  33.96 
 
 
129 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  21.78 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  30.26 
 
 
111 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0096  hypothetical protein  39.73 
 
 
78 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  23.11 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  23.11 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  31.91 
 
 
482 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  31.91 
 
 
467 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  22.56 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  29.85 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  23.35 
 
 
441 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  23.35 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  25.06 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  25.06 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  25.06 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  24.32 
 
 
466 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  25.34 
 
 
443 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  25.43 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>