94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0677 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  100 
 
 
451 aa  924    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  92.46 
 
 
451 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  34.89 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  34.89 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  34.89 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  34.89 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  34.64 
 
 
397 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
468 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  30.89 
 
 
441 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  29.88 
 
 
433 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  29.88 
 
 
433 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  29.88 
 
 
433 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  29.88 
 
 
433 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  28.28 
 
 
433 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  30.23 
 
 
420 aa  143  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  29.61 
 
 
448 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  29.61 
 
 
448 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  26.3 
 
 
494 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  28.51 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  27.05 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  27.05 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 
456 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  27.16 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  23.21 
 
 
420 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  31.78 
 
 
255 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  28.51 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  40.7 
 
 
111 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  36.3 
 
 
198 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  28.11 
 
 
263 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  37.61 
 
 
162 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  24.19 
 
 
451 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  29.7 
 
 
167 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.18 
 
 
472 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 
241 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4189  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.524375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  21 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  20.96 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  20.78 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  20.68 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  47.37 
 
 
111 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
469 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  30.69 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  20.79 
 
 
484 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2324  transposase, IS4  32.23 
 
 
118 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0625912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  28.44 
 
 
190 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>