68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6188 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6188  transposase  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  47.06 
 
 
494 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  48.83 
 
 
441 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  43.32 
 
 
433 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  43.32 
 
 
433 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  43.32 
 
 
433 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  43.32 
 
 
433 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  40.65 
 
 
433 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  37.3 
 
 
447 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 
456 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
468 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  35.25 
 
 
447 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  35.25 
 
 
447 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  37.02 
 
 
435 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 
447 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  32.19 
 
 
448 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  32.19 
 
 
448 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  39.6 
 
 
397 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  39.6 
 
 
397 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  39.6 
 
 
397 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  39.6 
 
 
397 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  39.6 
 
 
397 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  33.48 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  34.72 
 
 
420 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  31.74 
 
 
241 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  31.06 
 
 
451 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  46.08 
 
 
111 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  45.36 
 
 
111 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  35.88 
 
 
162 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  30.26 
 
 
177 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0089  hypothetical protein  46.15 
 
 
129 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>