87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0770 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  98.28 
 
 
465 aa  952    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  99.35 
 
 
465 aa  959    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  98.71 
 
 
465 aa  953    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  98.49 
 
 
465 aa  954    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  92.95 
 
 
466 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  99.78 
 
 
465 aa  962    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  99.14 
 
 
465 aa  958    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  98.63 
 
 
443 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  955    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  68.75 
 
 
465 aa  700    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  70 
 
 
441 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  54.99 
 
 
439 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  25.82 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  22.43 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  22.43 
 
 
467 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  23.72 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  22.51 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  24.53 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  24.53 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  20.13 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  20.34 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  22.91 
 
 
331 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  23.48 
 
 
484 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  22.4 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  22.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  22.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  22.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  22.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  23.92 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  22.05 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  20.18 
 
 
420 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  25.43 
 
 
447 aa  46.6  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  22.07 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  21.66 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  21.66 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  21.22 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>