80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4699 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 458 aa  925    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  761    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 458 aa  925    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  46.55 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  46.34 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  45.91 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  45.91 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  45.91 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  44.32 
 
 		 442 aa  336  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  37.53 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  37.53 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  44.44 
 
 		 307 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  40.42 
 
 		 329 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  53.71 
 
 		 191 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  47.92 
 
 		 96 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  21.22 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  27.25 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  25.53 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  25.53 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  23.43 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  23.25 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  24.46 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  24.46 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  24.46 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  24.46 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  24.46 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  54.55 
 
 		 110 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  22.93 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  25.06 
 
 		 473 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  28.33 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  24.68 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  23.37 
 
 		 465 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  26.99 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  25.94 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  26.14 
 
 		 457 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  27.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  31.68 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  31.68 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  31.68 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>