107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_6006 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  99.79 
 
 
482 aa  942    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  100 
 
 
467 aa  944    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  78.54 
 
 
482 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  78.54 
 
 
482 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  78.54 
 
 
482 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  65.42 
 
 
442 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  73.45 
 
 
329 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  46.55 
 
 
458 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  46.55 
 
 
458 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  45.92 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  81.77 
 
 
191 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  47.39 
 
 
307 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  37.96 
 
 
456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  37.96 
 
 
457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  46.67 
 
 
96 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  25.85 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  25.85 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  56.6 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  26.5 
 
 
473 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  24.28 
 
 
464 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  21.05 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  20.7 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  21.17 
 
 
469 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  20.48 
 
 
467 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  24.18 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  24.18 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  20.48 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
457 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  31.91 
 
 
447 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
457 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  22.07 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  22.07 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  26.34 
 
 
464 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  24.11 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  23.95 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  30.39 
 
 
190 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>