135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0133 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  99.75 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  41.65 
 
 
468 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  41.65 
 
 
468 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  41.65 
 
 
468 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  41.65 
 
 
468 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  41.65 
 
 
468 aa  315  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  42 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  41.19 
 
 
420 aa  305  7e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  41.6 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  39.64 
 
 
441 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  38.99 
 
 
435 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  39.73 
 
 
456 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  39.28 
 
 
447 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  39.28 
 
 
447 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  38.14 
 
 
447 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 
433 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 
433 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 
433 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  37.37 
 
 
433 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  37.95 
 
 
448 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  37.95 
 
 
448 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  35.38 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  33.49 
 
 
494 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  34.81 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  34.87 
 
 
263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  91.55 
 
 
162 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  39.05 
 
 
325 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  39.6 
 
 
255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  35.59 
 
 
241 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  40.38 
 
 
198 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  39.87 
 
 
167 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  27.8 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2324  transposase, IS4  38.33 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0625912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  41.86 
 
 
111 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  24.02 
 
 
465 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  24.53 
 
 
465 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  23.6 
 
 
465 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  23.6 
 
 
465 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  24.02 
 
 
465 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  47.76 
 
 
111 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  23.31 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  26.7 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  26.7 
 
 
443 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  24.43 
 
 
465 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  23.58 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  23.58 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>