85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1019 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  92.11 
 
 
456 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  95.94 
 
 
468 aa  945    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  95.94 
 
 
468 aa  945    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  95.94 
 
 
468 aa  945    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  95.94 
 
 
468 aa  945    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  95.94 
 
 
468 aa  945    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0603  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 
420 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  44.55 
 
 
447 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  43.9 
 
 
435 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  41.71 
 
 
447 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  41.71 
 
 
447 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  41.71 
 
 
447 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  41.42 
 
 
448 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  41.42 
 
 
448 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  42.25 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  42 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  35.24 
 
 
494 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  36.32 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  34.71 
 
 
433 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  33.18 
 
 
441 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  46.06 
 
 
325 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7794  transposase IS4 family protein  41.74 
 
 
241 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  28.6 
 
 
451 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6188  transposase  37.14 
 
 
255 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2324  transposase, IS4  59.32 
 
 
118 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0625912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1632  transposase, IS4  34.84 
 
 
263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3389  hypothetical protein  40.26 
 
 
198 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0086  transposase (24)  41.25 
 
 
167 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2484  hypothetical protein  44.25 
 
 
162 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0142982  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5077  hypothetical protein  39.17 
 
 
177 aa  96.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23249  normal  0.479185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  41.67 
 
 
111 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1630  hypothetical protein  38 
 
 
111 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  24 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
464 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0096  hypothetical protein  35.38 
 
 
78 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  23.53 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  23.53 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3707  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 
69 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  23.95 
 
 
467 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  23.95 
 
 
482 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  20.41 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  20.41 
 
 
441 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>