95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3605 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
433 aa  863    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
433 aa  863    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
433 aa  863    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  56.32 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  56.55 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  56.09 
 
 
464 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  55.71 
 
 
462 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  55.71 
 
 
462 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  55.71 
 
 
462 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  55.71 
 
 
462 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  54.79 
 
 
462 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  54.98 
 
 
465 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  56.26 
 
 
465 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  57 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  42.07 
 
 
468 aa  282  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  42.07 
 
 
468 aa  282  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 
468 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  45.05 
 
 
385 aa  269  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  39.96 
 
 
473 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 
456 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 
457 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  54.88 
 
 
189 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  28.3 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  28.1 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  53.85 
 
 
127 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  24.51 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  25.57 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  22.26 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  52.44 
 
 
243 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  57.14 
 
 
114 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  37.24 
 
 
162 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  23.92 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  23.92 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  23.09 
 
 
441 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  24.89 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  30.12 
 
 
191 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  24.69 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  24.69 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  21.82 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  21.5 
 
 
484 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3254  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.769506  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2271  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618073  normal  0.163793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2000  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0080  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627325  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4878  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889581  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  21.88 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0677  transposase IS4 family protein  22.53 
 
 
451 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0416857  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>