34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3087 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  76.25 
 
 
462 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  76.25 
 
 
462 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  76.25 
 
 
462 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  76.25 
 
 
462 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  68.75 
 
 
462 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  57.32 
 
 
464 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  52.08 
 
 
464 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  56.1 
 
 
464 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  51.61 
 
 
465 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  51.61 
 
 
465 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  50.54 
 
 
465 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  55.56 
 
 
464 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  59.68 
 
 
433 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  59.68 
 
 
433 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  59.68 
 
 
433 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  32.61 
 
 
473 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
457 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
456 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  57.45 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
468 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>