71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2323 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  98.5 
 
 
468 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  98.5 
 
 
468 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
468 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  65.13 
 
 
473 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  45.93 
 
 
464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  45.93 
 
 
464 aa  319  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  45.08 
 
 
465 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  45.51 
 
 
465 aa  292  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  44.37 
 
 
433 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  44.37 
 
 
433 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  44.37 
 
 
433 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  42.28 
 
 
462 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  42.28 
 
 
462 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  42.28 
 
 
462 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  42.28 
 
 
462 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  42.07 
 
 
462 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  46.77 
 
 
385 aa  279  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  64.2 
 
 
162 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
456 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
457 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  27.16 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  27.16 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  27.16 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  26.58 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  26.58 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  27 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  27 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  29.14 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  25.33 
 
 
442 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  23.1 
 
 
441 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  30.73 
 
 
191 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  22.39 
 
 
465 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  22.39 
 
 
465 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  37.63 
 
 
189 aa  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  22.35 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  22.35 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.19 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  21.62 
 
 
466 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  23.46 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  26.25 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>