22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3052 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  80.49 
 
 		 462 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  80.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  80.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  80.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  80.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  72.73 
 
 		 464 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  72.73 
 
 		 464 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  72.73 
 
 		 464 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  70.73 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  67.5 
 
 		 464 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  41.67 
 
 		 385 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>