74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2061 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  88.6 
 
 
464 aa  765    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  99.14 
 
 
465 aa  920    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  100 
 
 
465 aa  929    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  99.57 
 
 
465 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  66.15 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  66.15 
 
 
464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  66.15 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  63.85 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  63.85 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  63.85 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  63.85 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  62.99 
 
 
462 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  56.55 
 
 
433 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  56.55 
 
 
433 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  56.55 
 
 
433 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  44.47 
 
 
473 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  42.79 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  42.79 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  42.48 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  44.96 
 
 
385 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  60.78 
 
 
189 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  29.71 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 
457 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  51.61 
 
 
127 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  60.71 
 
 
243 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  27 
 
 
447 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  39.88 
 
 
162 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  24.78 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  24.73 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  24.73 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  70.73 
 
 
114 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  24.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  24.63 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  24.63 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  23.8 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  25.51 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  23.84 
 
 
458 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  23.84 
 
 
458 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  23.86 
 
 
448 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  23.86 
 
 
448 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  22.89 
 
 
435 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  30.29 
 
 
191 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>