40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0570 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  45.76 
 
 		 473 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  44.62 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  44.62 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  44.36 
 
 		 464 aa  269  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  45.01 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  45.01 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  45.01 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  45.01 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  44.79 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  44.79 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  44.79 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  45.15 
 
 		 464 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  44.07 
 
 		 462 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 465 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  45.52 
 
 		 468 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  45.52 
 
 		 468 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  38.27 
 
 		 162 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  51.11 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  26.89 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  26.89 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  28.33 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  28.33 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  27.84 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  22.65 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>