33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4493 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  315  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  82.61 
 
 
473 aa  229  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 
468 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  62.96 
 
 
468 aa  163  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  62.96 
 
 
468 aa  163  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  42.33 
 
 
385 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  44.97 
 
 
464 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  43.45 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  38.69 
 
 
464 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  38.69 
 
 
464 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  41.76 
 
 
462 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  38.69 
 
 
464 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
462 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
462 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
462 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
462 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
433 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  38.38 
 
 
189 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>