87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2076 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  88.6 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  89.46 
 
 
465 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  100 
 
 
464 aa  927    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  88.39 
 
 
465 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  63.64 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  64.62 
 
 
464 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  64.62 
 
 
464 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  64.62 
 
 
464 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  62.55 
 
 
462 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  57.04 
 
 
433 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  57.04 
 
 
433 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  57.04 
 
 
433 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  43.38 
 
 
473 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  43.56 
 
 
468 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  43.56 
 
 
468 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  43.78 
 
 
468 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  45.15 
 
 
385 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  61.76 
 
 
189 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  29.25 
 
 
456 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  29.25 
 
 
457 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  51.61 
 
 
127 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  61.9 
 
 
243 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  40.48 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4251  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4247  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4233  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4643  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4167  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0102  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3978  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3975  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3973  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.667634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3757  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00995603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3754  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3144  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3687  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3026  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00816022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2473  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0307213  normal  0.0396002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3737  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  25.39 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  23.63 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  23.63 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  24.57 
 
 
482 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  24.57 
 
 
467 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5331  IS4 family transposase  24.51 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.385872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  23.09 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  67.5 
 
 
114 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  23.09 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  23.09 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  23.09 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  23.09 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.22 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.22 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.22 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.22 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.22 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  26.14 
 
 
442 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  24.75 
 
 
458 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  24.75 
 
 
458 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 
448 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 
448 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>