22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 		 462 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  71.08 
 
 		 462 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  71.08 
 
 		 462 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  71.08 
 
 		 462 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  71.08 
 
 		 462 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  61.9 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  61.9 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  60.71 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  52.44 
 
 		 433 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  52.44 
 
 		 433 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  52.44 
 
 		 433 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>