230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3455 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3455  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  58.04 
 
 
433 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
420 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  47.77 
 
 
420 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.98 
 
 
399 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.89 
 
 
413 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.66 
 
 
402 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.85 
 
 
413 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  45.5 
 
 
440 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.98 
 
 
434 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.86 
 
 
405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.06 
 
 
407 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.05 
 
 
440 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.23 
 
 
413 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  49.77 
 
 
413 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.77 
 
 
413 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.98 
 
 
403 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.42 
 
 
413 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.95 
 
 
424 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  45.54 
 
 
406 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  41.52 
 
 
326 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.54 
 
 
393 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.75 
 
 
401 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.54 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.54 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.09 
 
 
397 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.59 
 
 
412 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.5 
 
 
412 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.86 
 
 
405 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  44.59 
 
 
412 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.59 
 
 
412 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.12 
 
 
417 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  42.86 
 
 
401 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  45.05 
 
 
411 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.5 
 
 
451 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  48.66 
 
 
411 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  48.66 
 
 
411 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.5 
 
 
412 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  45.05 
 
 
411 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  41.89 
 
 
425 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.91 
 
 
429 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.36 
 
 
415 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
412 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
412 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  47.32 
 
 
405 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
412 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
412 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  46.64 
 
 
416 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  46.88 
 
 
405 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.18 
 
 
417 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.56 
 
 
395 aa  164  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.26 
 
 
426 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.27 
 
 
416 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.1 
 
 
415 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.54 
 
 
419 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.09 
 
 
419 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  44.59 
 
 
412 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.44 
 
 
413 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.5 
 
 
430 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  43.69 
 
 
414 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
404 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
400 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
400 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
404 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
404 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
404 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.06 
 
 
412 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.98 
 
 
425 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.73 
 
 
419 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.21 
 
 
413 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.78 
 
 
425 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.95 
 
 
418 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.3 
 
 
392 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  41.44 
 
 
414 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  38.67 
 
 
422 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.44 
 
 
410 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.55 
 
 
418 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.29 
 
 
411 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  43.42 
 
 
411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.42 
 
 
411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.42 
 
 
411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  47.75 
 
 
403 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.9 
 
 
410 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
420 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.73 
 
 
415 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.41 
 
 
393 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.91 
 
 
395 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  40 
 
 
403 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.43 
 
 
398 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.52 
 
 
395 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  46.43 
 
 
398 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.43 
 
 
398 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.41 
 
 
412 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.4 
 
 
400 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.74 
 
 
401 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.56 
 
 
390 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.09 
 
 
390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.19 
 
 
409 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.83 
 
 
409 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.16 
 
 
403 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>